PubMed Linker - 文献链接查询与更新
Overview
系统化使用 MCP PubMed 工具查询文献信息并更新参考文献列表的链接，支持批量处理和全文下载检测。
Available MCP Tools
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pubmed_search/pubmed_quick_search— 搜索文献 - •
pubmed_get_details/pubmed_batch_query— 获取详细信息 - •
pubmed_extract_key_info— 提取关键摘要 - •
pubmed_download_fulltext/pubmed_batch_download— 下载全文 PDF - •
pubmed_detect_fulltext— 检测开放获取状态 - •
pubmed_cross_reference— 查找相关文献
Workflow
1. 解析引用
从 Reference_list.md 提取：第一作者姓氏、题目关键词(2-3个)、期刊名、发表年份。
2. 优先级搜索策略
策略 1：作者姓氏 AND 关键词1 AND 关键词2
策略 2：期刊名[ta] AND 年份[dp] AND 关键词
策略 3：完整题目精确匹配
3. 验证匹配
匹配成功需满足：PMID 存在、作者匹配、题目相似度 >80%、年份一致、期刊匹配。
4. 更新文档
在原始引用后添加：
markdown
- **PMID**: {PMID}
- **PubMed**: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/{PMID}/
- **DOI**: https://doi.org/{DOI}
- **Fulltext**: {下载链接或状态}
5. 批量处理
- •每次处理 5-10 篇，避免超时。
- •优先使用
pubmed_batch_query。 - •维护处理进度，支持断点续传。
Error Handling
- •未找到 → 尝试不同策略 → 标注
⚠️ 未找到匹配 - •多个匹配 → 选最佳 → 若有歧义标注
⚠️ 需人工确认 - •全文不可获取 → 检测开放获取 → 标注
🔒 订阅限制
Guardrails
- •精确性优先：多条件交叉验证。
- •保留原始引用格式不修改。
- •对无法确认的信息明确标注。
- •PubMed 数据库有延迟，最新文献可能未收录。
- •非 PubMed 收录文献需手动处理。