Model hint: Use
model: "sonnet"when spawning subagents for this skill (analytical task: 6-dimension academic review + cross-checking).
논문 교정 (proofread)
목적
색각 이상(CVD) 색 표상 fMRI 연구에 특화된 학술 리뷰를 수행합니다. Nature/NeuroImage 수준 리뷰어 관점에서 6가지 차원을 평가합니다.
주요 검토 대상
- •Primary:
analysis/METHODS_RESULTS_SUMMARY_FOR_PAPER.md - •Cross-reference:
analysis/phase2_SRM_across_between/results/내 실제 결과 - •Settings:
analysis/phase1_preprocess_decoding/README.md,analysis/prep_trials/README.md
6가지 검토 차원
A. 전처리 투명성 (Preprocessing Transparency)
평가 항목:
- •fMRIPrep 버전 및 파라미터 명시 여부
- •C010 (confound) 선택 근거 설명
- •Procrustes 정렬 방법 보고 완전성
- •공간 정규화: MNI152NLin2009cAsym, res-2 명시
- •스무딩 파라미터 및 high-pass 필터 명시
리뷰어 예상 질문:
code
"What confounds were regressed out and why were these specific regressors chosen?" "Was spatial smoothing applied before or after feature extraction?"
B. 통계적 엄밀성 (Statistical Rigor)
평가 항목:
- •4개 ROI (V1, V2, V3, hV4) 다중비교 보정 여부
- •exact p-value 보고 (p < 0.05로 뭉뚱그리지 않음)
- •순열검정 (permutation test) 사용 여부 및 반복 횟수
- •효과 크기 (Cohen's d) 보고
- •신뢰구간 보고
리뷰어 예상 질문:
code
"How were multiple comparisons across ROIs corrected?" "What was the number of permutations and how was the null distribution generated?"
C. 소표본 문제 (CRITICAL — Small Sample Concerns)
이 프로젝트의 가장 큰 약점: n=7 HC vs n=3 CVD
필수 점검:
- • n=3 CVD에 대한 group-level t-test 사용 회피
- • 개별 CVD 프로필 (sub-08, 09, 10) 보고
- • Bootstrap CI 사용 여부
- • 효과 크기 해석에 소표본 한계 명시
- • "group difference" 대신 "individual CVD patterns" 프레이밍
- • 비모수 검정 (Mann-Whitney, permutation) 사용
경고 문구 (반드시 포함):
code
"Given the small CVD sample (n=3), group-level statistical comparisons should be interpreted with caution. We report individual CVD profiles alongside group-level descriptive statistics."
리뷰어 예상 질문:
code
"With only 3 CVD subjects, how can you justify any group-level inference?" "Are the observed differences driven by a single outlier subject?"
D. 뇌영상 방법론 (Neuroimaging Specifics)
평가 항목:
- •MNI 공간 및 해상도 명시
- •ROI 정의 방법: Wang Atlas (2015) 사용 명시
- •SRM k-value 선택 근거
- •Cross-validation 방법 (leave-one-run-out 등)
- •BOLD 신호 추출 방법 (trial-wise beta 등)
리뷰어 예상 질문:
code
"How were ROI boundaries defined and what atlas was used?" "What was the rationale for the chosen number of SRM components?"
E. CVD 방법론 (CVD Methodology)
평가 항목:
- •CVD 진단 방법 명시 (Ishihara, anomaloscope 등)
- •CVD 하위 유형 구분 (protan, deutan, tritan)
- •자극 디자인의 CVD 가시성 고려
- •8색 자극의 색공간 좌표 보고
- •CVD 피험자가 자극을 지각할 수 있었는지 확인 방법
리뷰어 예상 질문:
code
"How did you ensure CVD subjects could perceive the stimuli?" "Were all CVD subjects of the same subtype, or mixed?"
F. 과대해석 탐지 (Overclaim Detection)
주요 주의 표현:
- •"preserved representation" → n=10에서 이런 결론 가능한가?
- •"similar neural patterns" → 통계적으로 유의한 유사성인가?
- •"color vision deficiency does not affect" → 강한 부정 주장의 근거?
- •"compensatory mechanism" → 기제 추론의 근거?
과대해석 레벨:
code
SAFE: "In our sample of 10 participants..." CAUTION: "These results suggest that..." DANGER: "CVD individuals show preserved..." CRITICAL: "Color vision deficiency does not affect neural..."
심각도 레벨
| 레벨 | 설명 | 조치 |
|---|---|---|
| CRITICAL | 결론에 영향, 리뷰어 거절 사유 | 즉시 수정 필수 |
| MAJOR | 방법론적 약점, 신뢰성 저하 | 수정 권장 |
| MINOR | 명확성 부족, 관례 미준수 | 개선 권장 |
| SUGGESTION | 선택적 개선 | 참고 |
동작 순서
- •대상 문서 읽기: METHODS_RESULTS_SUMMARY_FOR_PAPER.md (또는 지정 문서)
- •실제 결과 교차 확인:
analysis/phase2_SRM_across_between/results/등 - •6차원 평가 수행: 각 차원별 문제점 식별
- •심각도 분류: CRITICAL / MAJOR / MINOR / SUGGESTION
- •수정안 제시: 각 문제에 대한 구체적 수정 문구
- •종합 보고서 생성: 우선순위 기반 정리
출력 형식
markdown
# Proofreading Report — [날짜] ## CRITICAL Issues (즉시 수정) 1. [C-1] **소표본 그룹 비교**: ... - 현재: "..." - 수정안: "..." ## MAJOR Issues (수정 권장) 1. [M-1] **다중비교 미보정**: ... ## MINOR Issues (개선 권장) 1. [m-1] **fMRIPrep 버전 미명시**: ... ## SUGGESTIONS 1. [S-1] **개별 CVD 시각화 추가**: ... ## Summary - CRITICAL: N개 - MAJOR: N개 - MINOR: N개 - SUGGESTION: N개
체크리스트
- • 6개 차원 모두 평가됨
- • 심각도 레벨 분류됨
- • 실제 결과와 교차 확인됨
- • n=3 CVD 소표본 이슈 다뤄짐
- • 과대해석 표현 식별됨
- • 각 문제에 구체적 수정안 포함
- • 리뷰어 예상 질문 포함