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compound-query

根据smiles, cas-no, iupac name等条件，搜索完整的分子信息

中文原作
SKILL.md
--- frontmatter
name: compound-query
description: 根据smiles, cas-no, iupac name等条件，搜索完整的分子信息
license: Proprietary. LICENSE.txt has complete terms

Overview

Given a SMILES string, CAS number, IUPAC name, or similar identifiers, retrieve the compound’s complete molecular information.

bash
# 查询化合物（自动检测类型）
python compound_query.py "CCO"              # SMILES (乙醇)
python compound_query.py "ethanol"          # IUPAC 名称
python compound_query.py "64-17-5" -t cas   # CAS 号

# 查询并显示详细信息
python compound_query.py "CCO" -v

# 保存结果
python compound_query.py "CCO" -o ethanol.json
python compound_query.py "ethanol" -f json -o ethanol.json
python compound_query.py "ethanol" -f csv -o ethanol.csv

# 使用不同格式输出
python compound_query.py "CCO" -f json
python compound_query.py "CCO" -f csv

Arguments

参数名类型必填描述
smilesstring是化合物的smiles ｜
casstring是化合物的cas number

Quick Start

从pubchem获取化合物的信息

通过smiles查询

bash
python compound_query.py {{smiles}} -o compound.json

通过cas number查询

bash
compound_query.py {{cas}} -t cas -o compound.json