Tool Name: cohort_selector
Description
全能样本分组工具。 用于根据关键词(药物名、基因名、临床特征)将样本分为两组。
🎯 药物敏感性分组(推荐用法)
数据集包含以下药物的敏感性数据:
- •Sorafenib (索拉非尼) → 匹配
Organoid_Sorafenib_Sensitive(0=耐药, 1=敏感) - •Lenvatinib (仑伐替尼) → 匹配
Organoid_Lenvatinib_Sensitive - •Regorafenib (瑞戈非尼) → 匹配
Organoid_Regorafenib_Sensitive - •Apatinib (阿帕替尼) → 匹配
Organoid_Apatinib_Sensitive - •Bevacizumab (贝伐珠单抗) → 匹配
Organoid_Bevacizumab_Sensitive
⚠️ 注意事项
- •如果用户想研究药物靶点/耐药机制,应使用药物名作为 keyword
- •不要用 Pathology/肿瘤类型 分组来找药物靶点(会找到疾病差异而非药物响应差异)
Parameters
- •keyword (string, required): 分组依据的关键词 (e.g., Sorafenib, TP53, Lenvatinib).
- •method (string, optional): 分组方法 ("auto", "median", "quartile"). Default: "auto".
Command
python skills/cohort_selector/script.py --keyword {keyword} --method {method}